Nouakchott (Mauritania)
Sokoto (Nigeria)
Tamale (Ghana)
Kebbi (Nigeria)
Moroni (Komoro)
Dar es Salaam (Tanzania)
Setiap rute telah melalui proses persetujuan yang ketat dan pelaporan kepada otoritas penerbangan sipil terkait di negara keberangkatan dan negara tujuan. Jalur-jalur udara yang digunakan oleh Lion Air disusun dengan mempertimbangkan zona aman, efisiensi waktu terbang, serta penghindaran wilayah dengan potensi konflik udara.***